По словам Сергея Собянина, у правительства Москвы и Императорского общества есть несколько общих сфер деятельности — воспитание детей, забота о людях, попавших в беду, и укрепление межконфессионального согласия.

Российский православный университет будет осуществлять научное руководство исследовательской и проектной деятельностью учеников гимназии, разрабатывать новые учебные курсы и методические пособия, проводить в гимназии творческие конкурсы, олимпиады, совместные семинары и конференции.